Mam następujący kod. Jak widać nic skomplikowanego.
Jest to uproszczenie tego przykładu: http://javatechig.com/android/android-framelayout-example
Upraszczam, bo i tamten przykład nie działa prawidłowo i rozmieszczenie nie jest takie jak na obrazku.
Nie ma tu XML i jak to zrobić z XML wiem i działa, jak bez nie wiem. Najważniejsze, że nie chcę teraz XML.

Mam tło czerwone i to działa tak jak powinno.
Na tle chcę na środku mieć LinearLayouta o określonych wymiarach, a więc wiele nie wymagam ;).

Niestety ani przykład ze strony podanej wyżej, ani nawet mój uproszczony do maksimum nie działa i cały czas otrzymuje zarówno na emulatorze jak i rzeczywistym urządzeniu ten sam efekt, tj. czerwone tło i zielony prostokąt na górze z lewej strony. Przykład ze strony jest identyczny, czyli wszystko mi się pozycjonuje wg górnego lewego narożnika.
Żadna manipulacja rozmieszczeniem nie działa.

 protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
        super.onCreate(savedInstanceState);

      	widok_glowny = new FrameLayout(this);
      	widok_glowny.setBackgroundColor(Color.parseColor("#FF0000"));
      	widok_glowny.setLayoutParams(new LayoutParams(LinearLayout.LayoutParams.MATCH_PARENT,
      													LinearLayout.LayoutParams.MATCH_PARENT));
      	setContentView(widok_glowny);
        
      	LinearLayout abc = new LinearLayout(this);
      	abc.setGravity(Gravity.CENTER);
      	abc.setOrientation(LinearLayout.HORIZONTAL);

      	LinearLayout.LayoutParams wlp = new LinearLayout.LayoutParams(147,147);
      	wlp.gravity = Gravity.CENTER;
      	wlp.setMargins(0, 0, 0, 0);
	     	abc.setLayoutParams(wlp);
     	
      	abc.setBackgroundColor(Color.parseColor("#00FF00"));
      	widok_glowny.addView(abc);
      	//setContentView(widok_glowny);//czy tu czy tam i tak nie działa
     }

Dorzucam jeszcze XML aplikacji.
Nie wiem czy to potrzebne, bo ta sama aplikacja jak wywołam setContentView z gotowym layoutem z XML to rozmieszczenie jest ok.

<manifest xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
    package=..........."
    android:versionCode="1"
    android:versionName="1.0" android:installLocation="auto">

    <uses-sdk
        android:minSdkVersion="10"
        android:targetSdkVersion="19" />

    <application
        android:allowBackup="true"
        android:icon="@drawable/ic_launcher"
        android:label="@string/app_name">
        <activity android:name=".........GlowneOkno" android:label="@string/app_name" android:hardwareAccelerated="true" android:screenOrientation="portrait" android:configChanges="keyboardHidden|orientation|screenSize">
 			<intent-filter>
                <action android:name="android.intent.action.MAIN" />
                <category android:name="android.intent.category.LAUNCHER" />
            </intent-filter>
        </activity>
    </application>

</manifest>
     @style/AppTheme